截至2024年，扬州大学设有多个学院，涵盖文学、理学、工学、农学、医学、管理学、艺术学等12大学科门类。具体学院设置如下：
文学院
社会发展学院
马克思主义学院
法学院
教育科学学院（师范学院）
新闻与传媒学院
外国语学院
数学科学学院
物理科学与技术学院
化学化工学院
机械工程学院
信息工程学院（人工智能学院）
建筑科学与工程学院
水利科学与工程学院
电气与能源动力工程学院
环境科学与工程学院
农学院
园艺园林学院
动物科学与技术学院
兽医学院
生物科学与技术学院
医学部
医学院
护理学院·公共卫生学院
商学院
旅游烹饪学院
食品科学与工程学院
音乐学院
公共艺术教育中心（挂靠）
美术与设计学院
31. 海外教育学院
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