日本顶尖大学的排名如下：
东京大学
综合型大学，设有多个院系，包括法学、医药、科学、农业、经济学、艺术等。
2018年QS世界大学排名第28位。
京都大学
国立综合大学，以独立思考和判断能力为培养宗旨。
2018年ARWU世界大学学术排名中位列第35位。
东京工业大学
专注于理工科，是日本超级计算机之一的所在地。
2021年QS世界大学排名中位列第56位。
大阪大学
国立大学，以理工科较强，医学、高分子材料、人工智能等专业著称。
东北大学
国立大学，以金属材料、工程、物理、药学等专业闻名。
九州大学
综合研究型国立大学，拥有较大的校园。
名古屋大学
以科学研究闻名，是中部地区最著名的大学之一。
北海道大学
国立大学，以英语和日语授课为主，涵盖广泛的学科领域。
庆应义塾大学
私立大学，以文科和理工科实力平均，生物、政治、商等专业水平极高。
早稻田大学
私立大学，与庆应义塾大学齐名，是日本著名的教育机构之一。
以上排名根据不同的评价体系和时间可能有所变化，但以上信息基于近期的数据。