民办大学中确实存在一本和二本。虽然民办高校主要被认为是三本院校，但随着一些民办本科院校通过国家评核，它们也可以升级为二本院校。此外，还有少数民办本科院校因为发展较好，具备录取第二批考生的资格，甚至有的已经成立了博士办学点。
具体来说，民办一本大学数量较少，而二本和三本的民办大学数量较多。根据教育部的高校名单，全国的民办性质本科院校合计有411所，这些大学基本上都属于各省的民办二本。同时，民办本科包括转设的独立学院、部分中外合作高校的本科专业、民办普通本科高校，这些分类中已经明确包含了民办二本。
因此，民办大学不仅有三本，也存在二本院校，并且有一些民办高校正在努力提升其办学层次，以获得更多的认可和支持。在选择民办大学时，了解其具体的办学层次和资质是非常重要的。