二本C类和三本大学在多个方面存在一些差别：
学校性质
二本C类：通常是原来的三本院校，但有些省份已经将三本批次的招生和二本B类进行了合并招生，或者直接改为二本C类的招生。
三本：很多都是民办大学，而二本C类大学大部分都是公办大学。
学科要求
二本C类：更注重基础学科的学习，尤其是与专业相关的数学、物理、计算机等方面的知识。
三本：相对注重实践能力和专业技能的培养，对基础学科的要求较为宽松。
研究生录取
二本C类：学生相对于三本更容易被研究生院录取，因为他们在基础学科方面有更为扎实的基础。
三本：学生如果想读研究生，一般需要通过考研或者其他途径提高自己的竞争力。
学校水平
二本C类：整体实力相对较强，包括师资力量、科研水平、实验设备等方面更为优秀。
三本：整体实力相对较弱一些。
学费和就业
二本C类：学费通常比三本高一些，因为学校的整体水平更高。
三本：学费较低，但就业时可能会遭到小程度的区别对待，公办大学毕业生会占少许优势。
招生对象和录取时间
三本：招生对象是参加普通高等学校招生全国统一考试的普通高等教育本科考生，录取时间在普通本科第二批录取之前。
二本C类：招生对象和录取时间可能有所不同，具体取决于省份和学校的划分。
总的来说，二本C类和三本大学在办学性质、学科要求、研究生录取、学校水平、学费和就业等方面都存在一定的差别。虽然有些省份已经将三本批次的招生并入二本C类，但在就业市场上，三本院校的毕业生可能仍然会面临一些区别对待。因此，考生在选择学校时，应根据自己的兴趣、职业规划以及家庭经济情况，综合考虑这些因素。