一本大学有二本线的原因主要可以归纳为以下几点：
专业实力差异：
有些一本大学并非所有专业都达到一本专业的水平，而是有相当一部分专业是二本或专科专业。这些专业在招生时会按照二本或更低批次进行录取，从而形成一本线。
院校合并：
在2000年左右，中国大部分大学经历了合并潮。一些原本实力参差不齐的学校合并后，使用一个校名，但专业实力参差不齐。原来实力较强的专业仍然按照一本招生，而实力相对较弱的专业则可能按照二本招生。
专业热度：
同一所大学内的不同专业有冷热之分。一些热门专业由于报考人数多，录取分数高，因此放在一本批次招生；而一些冷门专业由于报考人数少，录取分数低，则放在二本批次招生。
教育资源分配：
一些一本大学虽然整体实力较强，但由于招生名额限制或其他原因，部分专业需要降格到二本批次进行招生，以确保招生名额的充分利用。
政策调整：
有些大学因为政策调整或教育部门的要求，将部分专业从二本批次调整到一本批次招生，这也会导致一本大学出现二本线。
综上所述，一本大学有二本线主要是由于专业实力差异、院校合并、专业热度、教育资源分配及政策调整等多种因素造成的。这种现象在一定程度上反映了不同专业之间的社会需求和教育资源的分配情况。