当前提供的信息中，关于制药工程专业的二本大学排名如下：
1. 成都中医药大学 - 四川
2. 黑龙江大学 - 黑龙江
3. 天津工业大学 - 天津市
4. 成都理工大学 - 四川
5. 湖南中医药大学 - 湖南
6. 烟台大学 - 山东
7. 河北工业大学 - 天津市
8. 青岛科技大学 - 山东
9. 兰州理工大学 - 甘肃
10. 南京工业大学 - 江苏
11. 福建农林大学 - 福建
12. 西北师范大学 - 甘肃
13. 西南民族大学 - 四川
请注意，排名可能会随着时间和不同评价机构的标准有所变化，建议参考最新的教育资源和排名信息