日本大学的排名差距确实较大，这主要体现在以下几个方面：
综合性与专业性的差异
国立大学：如东京大学、京都大学、东京工业大学等，这些大学在多个学科领域都有深厚的学术积淀和广泛的影响力，因此在综合排名中占据前列。
私立大学：如早稻田大学和庆应义塾大学，虽然在国内享有很高的声誉，但在国际排名中通常落后于国立大学，主要原因是这些私立大学在理工科领域的投入相对较少，而国际排名中理工科的分值贡献度较大。
学科设置的差异
国立大学：通常涵盖广泛的学科领域，包括理工科、文科、医学等，学科设置较为全面。
私立大学：多数以文科为主，理工科相对较弱，甚至有些私立大学没有理工科专业。
地理位置的影响
东京地区的大学：由于东京在经济、文化、教育等方面的中心地位，东京地区的大学如东京大学、京都大学、早稻田大学和庆应义塾大学等在国际排名中表现优异。
地方大学：一些位于地方城市的大学，如北海道旭川大学、札幌大谷大学等，由于地理位置和资源的限制，在国际和国内排名中的表现相对较差。
经费投入的差异
国立大学：通常得到政府较多的经费支持，能够投入更多的资源进行科研和设施建设。
私立大学：虽然有些私立大学如早稻田大学和庆应义塾大学在经费上也有较大的投入，但整体上理工科领域的投入仍然有限。
建议
选择大学时：学生可以根据自己的兴趣和职业规划，综合考虑大学的学科设置、地理位置和经费投入等因素，选择最适合自己的大学。
关注国际排名：虽然国际排名不能完全反映一所大学的全部实力，但可以作为参考之一，帮助学生了解大学在全球范围内的学术地位和影响力。
注重实践和应用：对于理工科学生来说，选择有较强实践和应用能力的大学，可能更有利于未来的职业发展。
希望这些信息对你有所帮助。