南京医科大学和南方医科大学均被认为是一本大学。
南京医科大学
南京医科大学是江苏省属重点建设大学，教育部卓越医生教育培养计划试点高校，国家特色重点学科项目建设高校，以及江苏省高层次人才培养计划——333工程培训基地。
在各省的招生批次中，南京医科大学通常在本科一批招生，因此被普遍认为是一本大学。
南方医科大学
南方医科大学是广东省高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校，也是广东唯一一所部委省共建高校，全国首批开设八年制本硕博连读临床医学专业的8所高校之一。
南方医科大学在全国基本上是第一批次招生，因此通常被认为是一本大学。
综上所述，无论是南京医科大学还是南方医科大学，它们都被认为是 一本大学。