南京的二本医学大学包括：
南京医科大学：
成立于1934年，原名江苏省立医政学院，1993年更名为南京医科大学，是江苏省属重点建设高校，也是教育部“卓越医生教育培养计划”试点高校。
南京中医药大学：
成立于1954年，是中国建校最早的高等中医药院校之一，是江苏省与国家中医药管理局共建高校，是国家“双一流”世界一流学科建设高校。
中国药科大学：
位于江苏省南京市，是教育部直属的大学，也是世界一流的学科建设大学。
以上信息根据最近的数据更新整理而来，具体情况可能会有所变化，建议访问相关大学的官方网站或教育部门发布的最新信息以获得最准确的答案