南京大学分数线较低的专业包括：
大气科学（中外合作办学）：
2024年录取分为647分，全省排名5323位，低于南京大学普通批其他专业的最低分661分14分。
医学专业：
2024年投档线为664分，全省排名2019位，虽然属于985大学的医学专业，但分数相对较低。
历史哲学、材料等专业：
这些专业由于较为冷门，分数也较低。
汉语言文学专业：
2023年最低录取分数线为648分（历史类）。
人工智能专业：
2023年最低录取分数线为670分（物理类）。
工学院中的机械工程、机械、电子信息以及农业电气化与自动化等专业：
这些专业的复试分数线均低于300分。
农学院中的遗传学、作物栽培学与耕作学等专业：
这些专业的复试分数线也在300分以下。
动物科技学院中的畜牧专业：
该专业的复试分数线也低于300分。
这些专业的录取分数线较低，主要是由于它们相对冷门，报考人数较少。建议对特定专业有浓厚兴趣或职业规划的考生可以考虑报考这些专业。