国内二本学生想要申请日本的大学院，可以考虑以下几所日本大学：
静冈大学：
位于静冈县静冈市骏河区大谷，是一所日本国立大学。
长崎大学：
位于长崎县长崎市，也是一所日本国立大学。
熊本大学：
位于九州熊本市，是一所日本研究型国立大学。
广岛大学：
位于广岛县东广岛市，是一所综合性国立大学。
明治大学：
位于东京都千代田区，是一所日本著名私立大学。
立教大学：
位于东京都丰岛区，是一所日本基督教私立大学。
上智大学：
位于东京都千代田区，是一所日本著名综合研究型私立大学。
申请条件和建议
日语能力：
通常要求日语N2级以上，文科类专业和日语专业学生要求N1级以上。如果没有日语成绩，建议先通过语言学校学习。
平均分：
虽然日本各大学院对平均分数要求不高，但要保证没有挂科，名校申请建议平均分75分以上。
英语成绩：
一流学府如东京大学、京都大学对英语有一定要求。
国内高校背景：
国内211、985院校毕业的学生在申请过程中会更有优势，但二本三本学生也有成功申请的可能，关键看个人条件和努力。
其他建议
语言学校：对于专科生、自考生、专升本等没有学位证的学生，建议先选择语言学校，通过语言学校的学习再申请日本大学院。
选择院校：可以根据自己的兴趣和专业方向选择合适的大学，同时考虑学校的地理位置、学费等因素。
提前准备：提前规划好留学时间，准备好所有必要的申请材料，提前进行日语和英语的学习和考试。
希望这些信息对你有所帮助，祝你申请顺利!