东京大学排名不高的原因可能包括以下几点：
多方面因素的综合影响：
世界大学排名考虑的因素广泛，包括学术影响力、科研水平、师资力量、国际化程度等。东京大学在某些方面可能不如其他名校，导致其排名较低。
学科专业的知名度和学生入学水平：
排名与大学的综合实力相关，东京大学在这些方面可能存在一些不足。
国际竞争对手的表现：
排名还会受到其他国际竞争对手大学的表现影响。
资金和财政问题：
日本大学世界排名下降的一个重要原因是研究能力下降，其背后隐藏的一个重要原因是海外大学和日本大学在创造研究环境、培养学生和优秀的年轻研究人员方面，存在资金和财政上的差距。
国际化程度不足：
日本国内大学相对比较缺乏外国留学生、外籍教师以及外语授课，因此在国际性领域的评分较低，进而拉低了总体排名。
评价标准的变化：
某些排名机构在评价标准上的变更，例如降低了论文被引用次数的评分，也可能影响排名结果。
综合以上因素，东京大学排名不高可能是由于多方面原因共同作用的结果。尽管东京大学在日本国内有着很高的声誉和地位，但相对于一些国际顶尖大学，其综合实力还有提升的空间。