重庆大学的“自定”学科是指 没有达到双一流学科的建设标准，但出于照顾性质而被学校自主确定的A类学科。具体原因可能包括：
学科精度问题：
有观点认为，重庆大学三个学科都是自定，可能意味着该校在学科精度上存在问题，没有达到双一流学科的标准。
发展策略：
有网友指出，重庆大学可能“抱残守缺”，一直在传统工科上发展，没有在新工科领域进行过多探索，这可能导致了其在某些双一流学科的评选中未能脱颖而出。
政策因素：
重庆大学作为985高校，根据教育部的相关要求，自行选出了较强、有竞争力的专业作为A学科专业。这些自定学科通常被认为是学校认为在学术研究、师资队伍、科研成果等方面具有较高水平的学科，并且得到了校内外的广泛认可。
评估规则：
在教育部学科评估中，学科评估采用客观评价与主观评价相结合的方式，包括师资队伍、科学研究、人才培养、学科声誉等多个一级指标。重庆大学可能根据这些评估规则，自行确定了部分A类学科。
延续性考虑：
尽管重庆大学入选了“世界一流大学A类建设高校”，但其入选的3个世界一流学科建设项目全部为自定学科。这可能是因为重庆大学为了保持985工程的延续性，才得以入选这些学科，但这同时也表明这些学科并未完全达到教育部的建设标准。
综上所述，重庆大学的自定学科主要是由于其在某些方面未达到双一流学科的建设标准，但学校为了保持其作为985高校的地位和延续性，自主确定了这些学科。