南京最好的大学排名如下：
南京大学
全国排名第5名
双一流、211、985工程大学
东南大学
全国排名第17名
双一流、211、985工程大学
南京航空航天大学
全国排名第36名
双一流、211工程大学
河海大学
全国排名第37名
双一流、211工程大学
南京师范大学
全国排名第62名
双一流、211工程大学
南京理工大学
全国排名第43名
双一流、211工程大学
南京农业大学
全国排名第38名
双一流、211工程大学
南京工业大学
全国排名第50名
双一流、211工程大学
南京邮电大学
全国排名第50名
双一流、211工程大学
南京信息工程学院
全国排名第8名
双一流、211工程大学
南京财经大学
全国排名第10名
双一流、211工程大学
南京审计大学
全国排名第7名
双一流、211工程大学
中国药科大学
全国排名第11名
双一流、211工程大学
南京医科大学
全国排名第12名
双一流、211工程大学
南京林业大学
全国排名第13名
双一流、211工程大学
南京中医药大学
全国排名第14名
双一流、211工程大学
建议：
南京大学和 东南大学是南京市乃至全国最顶尖的大学，具有极高的学术声誉和研究实力。
南京航空航天大学在航空航天领域具有显著优势，是相关领域的重要高校。
河海大学、 南京师范大学、 南京理工大学等也是国内知名的综合性大学，各有其特色优势学科。
这些排名综合了多个来源的数据，并考虑了学校的整体实力、学科评估结果以及在全国范围内的排名情况。建议学生在选择学校时，可以综合考虑这些因素。