在自动化专业方面，以下大学被认为是最好的：
清华大学：
清华大学的自动化专业在国内处于领先地位，拥有优秀的师资力量和科研条件。该专业注重理论与实践相结合，培养学生的创新能力和解决实际问题的能力。毕业生在就业市场上具有很高的竞争力，深受用人单位的青睐。
西安交通大学：
西安交通大学的自动化专业是国家级特色专业及国家级卓越计划专业，在软科电气工程学科排名中位列第一。
华中科技大学：
华中科技大学的自动化专业在教育部第四轮学科评估中获得A+等级，专业实力雄厚。
浙江大学：
浙江大学的自动化专业具有悠久的历史和丰富的教学经验，注重理论与实践相结合，课程设置丰富多样。毕业生在自动化领域具有广泛的就业前景和发展空间。
北京航空航天大学：
北京航空航天大学的自动化专业是其重点学科之一，拥有多个国家级和省部级重点实验室和研究中心，致力于研究航空、航天、民航等领域的自动化技术和应用。
上海交通大学：
上海交通大学的自动化专业同样具有很强的实力，注重培养学生的工程实践能力和创新能力。
哈尔滨工业大学：
哈尔滨工业大学的自动化专业在航天、航空、机器人等领域具有显著优势。
东南大学：
东南大学的自动化专业在智能系统、网络控制等方面有深入研究。
北京理工大学：
北京理工大学的自动化专业在车辆工程、智能制造等领域有突出表现。
华南理工大学：
华南理工大学的自动化专业在工业自动化、机器人技术等方面有较强实力。
这些大学在自动化专业方面都有很高的声誉和实力，建议根据个人兴趣、学术目标和地域偏好等因素进行选择。