东北财经大学设有多个学院和教学部，涵盖了经济学、管理学、法学、文学、理学、工学、工程学等多个学科领域。以下是东北财经大学的院系设置：
经济学院
成立于1997年9月，前身是东北财经大学经济系。
整合数量经济学科后成立新经济学院。
现有经济学专业、数字经济专业。
主要专业课包括微观经济学、宏观经济学、微观计量及stata应用。
管理学院
包括工商管理、市场营销、人力资源管理和物流管理专业。
是教育部首批“三全育人”院级综合改革试点单位。
金融学院
开设保险学、投资学、金融学、金融工程等专业。
拥有金融学博士后流动站。
会计学院
成立于1995年12月，拥有本科、硕士和博士等全部层次的人才培养体系。
现有会计学专业、财务管理专业、资产评估专业和审计学专业。
财政税务学院
成立于1996年，设有财政学、税务专业。
具有经济学学士学位、硕士学位和博士学位的授予权。
国际商学院
开设会计学（与澳大利亚科廷大学合作办学项目）、会计学（与英国奥斯特大学合作办学项目）等专业。
拥有经济学（与加拿大西安大略大学国王大学学院合作办学项目）、金融学（与英国奥斯特大学合作办学项目）等专业。
统计学院
始建于1948年，是学校设置最早的专业之一。
统计学专业为财政部和辽宁省首批重点学科。
信息管理学院
开设信息管理与信息系统、大数据管理与应用、电子商务、管理科学等专业。
拥有管理科学与工程一级学科博士学位授权点。
法学院
开设法学专业。
拥有法学硕士学位授予权。
外国语学院
开设商务英语、日语等专业。
培养国际化人才。
数学与计算科学学院
开设数学与应用数学专业。
培养数学基础扎实的人才。
计算机科学与工程学院
开设计算机科学与技术专业。
培养计算机领域专业人才。
电子信息技术学院
开设电子信息工程专业。
培养电子信息技术领域人才。
材料科学与工程学院
开设材料科学与工程专业。
培养材料科学领域人才。
环境科学与工程学院
开设环境科学与工程专业。
培养环境科学领域人才。
体育教学部
负责体育课程的教学工作。
基础教学部
负责基础课程的教学工作。
继续教育学院
负责成人教育和继续教育。
国际教育交流学院
负责国际学生的教育和交流。
创新创业学院
培养创新创业人才。
电子商务学院
开设电子商务专业。
高等经济研究院
进行经济领域的研究工作。
高等职业技术学院
培养高职教育人才。
津桥商学院
位于大连经济技术开发区，是一个独立学院。
旅游与酒店管理学院
开设旅游管理、酒店管理专业。
马克思主义学院
进行马克思主义教学和研究。
人文与传播学院
开设广告学、新闻学等专业。
萨里国际学院
开设工商管理（萨里国际学院专业）、旅游管理（萨里国际学院专业）、财务管理（萨里国际学院专业）。
数据科学与人工智能学院
开设统计学、计算机科学与技术、金融数学等专业。
投资工程管理学院
开设