日本顶级医药大学的排名如下：
东京大学医学部
日本国内排名：第1位
全球排名：第26位
特点：门槛高，淘汰率高，保证了其在亚洲大学中的领先地位。
京都大学医学部
日本国内排名：第2位
全球排名：第51-100位
特点：与东京大学类似中国的北大和清华，医学部师资和技术水平高。
大阪大学医学部
日本国内排名：第3位
全球排名：第51-100位
特点：世界排名稳定，汤川秀树为日本第一位诺贝尔奖得主，科研人才辈出。
庆应义塾大学医学部
日本国内排名：第4位
全球排名：第101-150位
特点：私立大学中最好，但学费昂贵，学制长，不太适合工薪家庭留学生。
东京医科齿科大学医学部
日本国内排名：第5位
特点：日本最好的牙科大学，综合实力强。
九州大学医学部
日本国内排名：第6位
全球排名：第51-100位
特点：历史悠久，癌症治疗、齿科和心脏介入等领域享有国际声誉。
东北大学医学部
日本国内排名：第7位
特点：重视医学研究和教育，医学院设有医学科学系和健康科学系。
奈良医科大学医学院
日本国内排名：第8位
特点：以MBT为特色，期望学生利用专业技能为社会贡献。
名古屋大学医学部
日本国内排名：第9位
特点：设有医学部和健康科学部，提供全面的医学教育。
东京慈恵会医科大学医学部
日本国内排名：第10位
特点：日本私立大学历史最悠久的名门医学部之一，入学难度大。
以上排名基于最近的信息，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。