当前中国物理系最好的大学包括：
清华大学：
物理系成立于1926年，是中国成立最早的物理系之一，物理和天文学是国家一级重点学科。
北京大学：
物理系是中国物理系本科教育的开端，物理和大气科学是国家一级重点学科。
中国科学技术大学：
物理系起始于1958年，凝聚态物理、光学是国家重点学科。
南京大学：
物理学科创立于1915年，凝聚态物理、理论物理、微电子学与固体电子学是国家重点一级学科。
复旦大学：
物理系始建于1952年，理论物理、凝聚态物理和光学是国家重点一级学科。
浙江大学、 上海交通大学、 华南师范大学等也是物理系全国排名前列的大学。
这些大学的物理专业通常被认为是国内顶尖的，拥有雄厚的师资力量和先进的科研设施，并在各自的研究领域有着卓越的贡献。