德国大学排名偏低的原因是多方面的，以下是一些主要因素：
学术水平在某些领域不是最高：
德国大学的学术水平在某些领域可能不是世界最高，这可能影响到整体排名。
科研投入相对较少：
德国大学在科研领域的投入相对较少，这也会影响到整体的排名。
学科设置和评价标准存在差异：
德国大学的专业设置更注重实践性和应用性，而非理论性，这与一些排名评价标准可能存在不匹配。
国际化程度较低：
德国大学在吸引国际学生和教师方面可能不如其他国家的大学，这也会影响到排名。
排名评价标准的主观性和片面性：
排名评价标准本身存在一定的主观性和片面性，不能完全依赖排名来评价一个大学或一个国家的整体水平。
教育资源分配：
德国之前本着教育资源公平的原则，并不提倡对本国个别大学在经济、政策上进行扶植和倾斜，导致德国的大学各有各的学科特色，大部分高校只是在个别学科上很突出。
学术语言：
学术界的官方语言是英语，而德国大学在英文论文发表和学术交流方面可能存在不足，这也会影响到排名。
科研方向：
德国高校和企业的科研生产贴近市场应用，而应用领域的技术大多是成熟的科技，不会处于学术领域的尖端，这使得德国在纯科研的尖端领域成果较少。
综合类大学较少：
德国缺少综合类大学，而专业性大学较多，这导致各个大学之间只有专业排名，没有学校排名。
排名操纵：
国际排行榜多为英美操纵，对德国大学不利。
综上所述，德国大学排名偏低的原因是多方面的，包括学术水平、科研投入、学科设置、国际化程度、评价标准的主观性和片面性、教育资源分配、学术语言、科研方向、综合类大学较少以及排名操纵等因素。尽管如此，德国大学在工程、机械、电子、能源化工等应用领域仍然具有很高的教育质量和研究水平。