民办大学和独立学院都是利用非国家财政性教育经费举办的高等教育机构，但它们之间存在一些关键的区别：
办学主体和资金来源
民办院校：由企业事业组织、社会团体及其他组织和公民个人利用非国家财政性教育经费举办，具有独立的法人资格和自主的办学权。
独立学院：是普通高等学校与社会力量（企业、事业单位、社会机构或个人）合作举办的本科以上学历教育机构，其名称通常带有“XX大学XX学院”的格式，以区别于母体高校。
办学层次和学历证书
民办院校：提供专科、本科甚至研究生教育，毕业证书上加盖学校的校名印章。
独立学院：只实施本科学历教育，毕业证书上加盖的是合作举办的母体大学的印章。
教学管理和资源共享
民办院校：具有较大的自主性和灵活性，可以独立进行教学组织和管理，独立颁发学历证书，拥有独立的财政体系。
独立学院：通常与母体高校共享部分教学资源，如图书馆、实验室等，教学质量受到母体学校的监督和指导。
社会认可度和性质
民办院校：完全由社会力量举办，依法享有民办教育促进法等各项奖励与扶持政策，属于公益性事业。
独立学院：虽然具有民办性质，但其举办方通常是普通高校，因此可能在某些方面获得更多的支持和资源。
发展趋势
民办院校：继续独立发展，部分民办院校通过转设成为独立的办学实体，有的转为公办高校。
独立学院：部分独立学院逐步转设为独立的民办普通高等学校，有的则保留挂名高校的资源支持。
总结：
民办大学和独立学院在办学主体、资金来源、办学层次、学历证书、教学管理和社会认可度等方面存在明显的区别。独立学院作为民办高等教育的重要组成部分，其独立性逐渐增强，部分独立学院已经转设为独立的民办普通高等学校。建议在选择就读时，了解各学校的具体情况，包括教育质量、学费水平、就业前景等，以便做出更为合适的选择。