日本公办医学大学的排名如下：
1. 东京大学医学部
2. 京都大学医学部
3. 大阪大学医学部
4. 东京医科歯科大学
5. 东北大学医学部
6. 九州大学医学部
7. 名古屋大学医学部
8. 千叶大学医学部
9. 神户大学医学部
10. 广岛大学医学部
11. 筑波大学医学部
12. 冈山大学医学部
13. 大阪市立大学医学部
14. 京都府立医科大学医学部
15. 熊本大学医学部
16. 横浜市立大学医学部
17. 金泽大学医学部
18. 北海道大学医学部
19. 长崎大学医学部
20. 岐阜大学医学部
21. 新潟大学医学部
以上排名根据不同的评价标准和时间可能会有所变动，请参考最新的排名信息以获得准确数据