厦门的本科二本大学包括：
厦门理工学院：
位于福建省厦门市，是一所全日制普通本科院校，创建于1981年，原名鹭江职业大学，2004年更名为厦门理工学院。学校以工为主，理、管、文、艺等多学科协调发展。
厦门医学院：
位于福建省厦门市，是一所全日制普通本科院校，是福建省属公办普通本科高等学校，也是福建省三所医学类本科高校之一。学校前身为厦门护士学校、厦门医士学校和厦门助产学校，于2007年经教育部批准升格为本科院校并更名为厦门医学高等专科学校，于2016年经教育部批准更名为厦门医学院。
集美大学：
位于福建省厦门市集美区，是一所综合性大学。虽然集美大学在多数省份属于一本招生，但仍有部分专业在部分省份按照二本批次进行招生。
厦门华厦学院：
位于福建省厦门市，是一所民办二本大学。
厦门工学院：
位于福建省厦门市，是一所民办二本大学。
华侨大学：
虽然是一所一本大学，但有时在福建省内也被归类为二本大学进行招生。
建议：
厦门理工学院和 厦门医学院是厦门地区较为知名的二本大学，分别侧重于理工科和医学专业，值得考虑。
集美大学虽然整体实力较强，但在某些省份可能按照二本批次招生，可以根据具体省份的招生政策进行选择。
厦门华厦学院和 厦门工学院为民办二本大学，可能具有不同的办学特色和优势，可以根据个人兴趣和需求进行选择。