超过二本线56分的大学名单如下：
1. 杭州医学院：最低分数533分
2. 锦州医科大学：最低分数523分
3. 山西医科大学（汾阳学院）：最低分数515分
4. 北京联合大学：最低分数未明确，但在540-560分之间
5. 南昌航空大学（软件类）：最低分数未明确，但在540-560分之间
6. 温州医科大学：最低分数557分
7. 贵州医科大学：最低分数555分
8. 新乡医学院：最低分数未明确，但在540-560分之间
9. 湖北医药学院：最低分数549分
10. 湖南医药学院：最低分数528分
11. 河北医科大学临床学院：最低分数522分
建议：
杭州医学院、 锦州医科大学、 山西医科大学（汾阳学院）等学校的分数相对较低，超过二本线56分的学生可以考虑报考。
温州医科大学、 贵州医科大学等学校的分数较高，但仍在560分以内，也是不错的选择。
北京联合大学、 南昌航空大学（软件类）、 新乡医学院等学校的具体分数未明确，建议进一步查询以获得更准确的录取信息。