日本最厉害的大学排名如下：
东京大学
世界排名：通常位于前列，具体数字会根据不同排名机构和年份有所变化。
特点：日本顶尖的综合性大学，以理科和工科见长，培养了多位诺贝尔奖得主和日本首相。
京都大学
世界排名：通常位于前列，具体数字会根据不同排名机构和年份有所变化。
特点：日本顶尖的综合研究型大学，以科学研究和文科教育著称，被称为“科学家的摇篮”。
东京工业大学
世界排名：通常位于前列，具体数字会根据不同排名机构和年份有所变化。
特点：专注于工程技术与自然科学的世界一流理工大学，以实用科学与工程教育闻名。
大阪大学
世界排名：通常位于100位以内。
特点：一流大学，以广泛的研究领域和学术实力著称。
东北大学
世界排名：通常位于50位左右。
特点：以医学、工学、理学等领域闻名，是中国著名数学家苏步青的毕业院校。
庆应义塾大学
世界排名：通常位于前列，具体数字会根据不同排名机构和年份有所变化。
特点：名牌私立大学，以文科和理工科实力平均著称。
早稻田大学
世界排名：通常位于前列，具体数字会根据不同排名机构和年份有所变化。
特点：日本最有名的私立大学之一，培养了多位日本首相。
九州大学
世界排名：通常位于前列，具体数字会根据不同排名机构和年份有所变化。
特点：日本顶尖的综合性研究型大学之一。
名古屋大学
世界排名：通常位于前列，具体数字会根据不同排名机构和年份有所变化。
特点：日本著名的综合性大学，以理工科和医学研究著称。
北海道大学
世界排名：通常位于前列，具体数字会根据不同排名机构和年份有所变化。
特点：日本历史悠久的国立大学，以自由的学术氛围和全面的研究水平著称。
以上排名根据历史数据和不同排名机构的评价综合得出，具体排名情况请参考最新的QS、泰晤士等权威排名机构的最新数据