日本国立大学和公立大学的主要区别包括：
设立主体和经费来源
国立大学：由日本文部省管辖，由国家全额出资建立，经费来自国库。
公立大学：由地方政府设立，经费主要来源于政府财政拨款。
学费
国立大学：学费由国家统一规定，通常较低，例如一年学费约为53.58万日元（约合人民币2.5万元）。
公立大学：学费由地方政府设定，与国立大学相近，但可能因地区差异略有不同。
入学形式
国立大学：注重学生全面发展，对各科成绩和研究能力要求高，设有研究生制度。
公立大学：入学考核相对宽松，部分学校对留学生开放，门槛较低。
学校排名和声誉
国立大学：通常具有较高的学术水平和全球声誉，如东京大学、京都大学等。
公立大学：学术水平和入学难度因地区而异，但整体实力较为均衡。
学校性质
国立大学：不以盈利为目的，更注重科研和教育质量。
公立大学：旨在培养地方经济和文化发展所需人才，与当地紧密相关。
数量与分布
国立大学：共有86所，分布在日本各地。
公立大学：共有90余所，同样分布在日本各地。
专业设置
国立大学：专业设置倾向于研究性，以科研成果为宗旨。
公立大学：专业设置也倾向于学术性，但总体研究水平略低于国立大学。
选择国立大学还是公立大学，取决于个人的学术目标、经济状况以及对未来规划的需求。国立大学可能更适合追求高学术水平和研究机会的学生，而公立大学可能更适合希望在当地就业或对学费较为敏感的学生