根据2024年最新的排名情况，南山区的两所重点大学排名如下：
深圳大学
2023年科睿唯安ESI排名：全国第36位。
2024年QS世界大学排名：全球第150位。
2023年泰晤士高等教育世界年轻大学排名：世界第87位。
2023年软科世界大学学术排名：全球第101-150名。
南方科技大学
2023年科睿唯安ESI排名：全国第62位。
2024年QS世界大学排名：全球第150位。
2023年泰晤士高等教育世界年轻大学排名：世界第17位。
2023年软科世界大学学术排名：全球第101-150名。
建议：
深圳大学和南方科技大学均表现优异，位列全国和世界前列。
对于有意向就读的学生和家长，可以根据具体需求和偏好，选择适合自己的学校。