当前，对口支援新疆的大学包括但不限于以下这些：
新疆大学
对口支援高校：清华大学、西安交通大学、武汉大学、中南大学、北京师范大学、同济大学等。
石河子大学
对口支援高校：北京大学、华中科技大学、华中农业大学、华东理工大学、重庆大学、江南大学、对外经贸大学等。
塔里木大学
对口支援高校：中国农业大学、浙江大学、华中农业大学、东北大学、北京化工大学等。
新疆师范大学
对口支援高校：中国科学技术大学、华东师范大学。
喀什大学
对口支援高校：南开大学、华中师范大学、天津大学等。
其他高校
对口支援新疆的其他高校还包括北京航空航天大学新疆研究院、北京林业大学乌鲁木齐教学点、北京联合大学乌鲁木齐校区等。
这些对口支援项目旨在通过教育合作，提升新疆当地的教育质量，培养专业人才，促进当地经济社会的发展。