南京的正牌大学排名如下：
南京大学
985工程
211工程
世界一流大学建设A类高校
东南大学
985工程
211工程
世界一流大学建设A类高校
南京航空航天大学
211工程
双一流建设高校
南京理工大学
211工程
双一流建设高校
河海大学
211工程
双一流建设高校
南京农业大学
211工程
双一流建设高校
南京师范大学
双一流建设高校
中国药科大学
双一流建设高校
南京邮电大学
双一流建设高校
南京信息工程大学
双一流建设高校
建议：
南京大学在各项排名中均位列第一，是南京市乃至全国都非常重要的高校。
东南大学紧随其后，同样是一所顶尖的综合性大学。
南京航空航天大学、南京理工大学、河海大学和南京农业大学也都是国内一流的大学，具有较高的学术声誉和影响力。
其他如南京师范大学、中国药科大学、南京邮电大学和南京信息工程大学虽然排名稍后，但也在各自的领域有着较高的声誉和实力。