牛津大学的学院并不是按照学科来划分的，而是将不同学科的学生融合在一个学院内。每个学院都是一个独立的法人，拥有自己的教师、职员、校舍、基金以及各种学习和生活娱乐设施。学院的职责主要包括选拔本科生，并且每个学院在发展过程中形成了各自独特的传统。
牛津大学共有39个学院，例如：
万灵学院（All Souls College）
贝利奥尔学院（Balliol College）
布雷齐诺斯学院（Brasenose College）
基督教堂学院（Christ Church College）
基督圣体学院（Corpus Christi College）
艾克塞特学院（Exeter College）
格林坦普顿学院（Green Templeton College）
哈里斯˙曼彻斯特学院（Harris Manchester College）
赫特福德学院（Hertford College）
耶稣学院（Jesus College）
基布尔学院（ Keble College）
凯洛格学院（Kellogg College）
玛格莉特夫人学堂（Lady Margaret Hall）
李纳克尔学院（Lincoln College）
林肯学院（Lincoln College）
学院制使得学生即使属于不同的专业或年级，也能在同一个学院内共同学习和生活。学院在财政上是独立的，但在某种程度上与牛津大学中央是联邦制的。