国内最顶尖的二本大学包括以下几所：
哈尔滨医科大学：
全国排名第51位，尤其在医学领域有着雄厚的实力，临床医学、基础医学、药学等学科均处于国内领先地位。
北京中医药大学：
全国排名第83位，作为中医药领域的顶尖院校之一，中医学和中药学等学科方面历史悠久，学科实力强劲。
重庆医科大学：
全国排名第86位，是西南地区重要的医学教育基地，在临床医学、护理学、药学等领域具有较强的教学和科研能力。
河北医科大学：
全国排名第121位，在医学教育领域享有较高声誉，其多个医学学科均具有较强实力。
福建农林大学：
全国排名第125位，在农林学科领域具有显著优势，其农业科学、林学等学科在国内享有较高声誉。
广东财经大学：
财经特色铸就“黑马”，在产学研合作方面取得了显著进展，与200多家企业建立了密切的合作关系。
贵州医科大学：
西部医学教育的一匹黑马，临床医学、公共卫生与预防医学两个学科已进入ESI全球前1%。
南京工程学院：
具有百年办学历史，拥有电气工程及其自动化、机械设计及其自动化等优势专业。
桂林电子科技大学：
在电子信息领域是实力派，机械工程、仪器科学与技术等学科评估中表现优异。
西安财经大学：
统计学领域的佼佼者，统计学专业是国家级特色专业。
这些大学在各自的领域具有显著的优势和特色，虽然它们在全国的排名中属于二本，但在某些专业或领域内的教学质量和学术水平已经达到了顶尖的位置。建议学生在选择大学时，可以根据自己的兴趣和专业方向，综合考虑这些学校的优势和特色。