2003年中国大学排行榜中，清华大学、北京大学和复旦大学位列前三名。以下是部分排名情况：
1. 清华大学：总分100.00分
2. 北京大学：总分99.35分
3. 复旦大学：总分64.92分
4. 浙江大学：总分64.55分
5. 南京大学：总分50.28分
6. 上海交通大学：总分46.83分
7. 武汉大学：总分45.59分
8. 吉林大学：总分41.23分
9. 华中科技大学：总分38.30分
10. 中国科学技术大学：总分38.14分
以上排名信息来源于不同时间发布的排行榜，可能存在细微差异。如果您需要更详细的信息或其他年份的排名，请告知