二本大学合并的好处主要包括以下几点：
消除观念上的歧视：
二本三本批次合并后，统称为本科专业，有助于消除人们对不同批次院校之间的等级观念和歧视。
提供更多选择机会：
合并后，考生可以填报更多数量的志愿学校，增加了被录取的机会，同时也提高了填报的灵活性。
缓解高校招生压力：
高校不再过分争夺一本批次的生源，可以更专注于学科专业的发展，从而提高教育质量。
以专业为核心选择大学：
合并后，考生可以根据自己的特长和兴趣选择专业，而不是单纯以大学层次为依据。
提高未来就业率：
合并批次后，学生更容易选到自己喜欢的专业，从而提高未来的就业率。
促进教育公平竞争：
二本三本合并有助于鼓励大学办出自己的特色，培养更具竞争力的人才，减少就业歧视。
降低省控线：
对于部分考生而言，合并后二本批次的控制线会降低，使得更多人有机会考入二本院校。
提高生源质量：
二本和三本在招生上同时进行，有助于提高三本院校的生源质量。
拓展学生选择机会：
合并本科第一、二批次，考生填报高校志愿、专业志愿的数量不变，志愿填报的空间并未减少，有助于进一步引导考生根据自身兴趣特长和社会对人才的需求填报志愿。
促进素质教育：
合并本科第一、二批次，有利于高中学校破除盲目追求“一本率”，缓解学校的升学率压力，减轻师生不合理教学负担，深入推进素质教育。
减少就业歧视：
逐步取消普通高等学校录取批次，有利于普通高等学校毕业生平等就业。
增加教育公平性：
合并二本三本院校有助于消除社会对第三批院校毕业生的偏见，实现高校毕业生平等竞争就业。
综上所述，二本大学合并有助于提高教育质量、增加学生的选择机会、促进教育公平和减少歧视，对考生、高校和社会都有积极的影响。然而，合并也可能带来一些挑战，如分数判断难度的增加和志愿填报的风险增加，这些需要在实践中不断调整和优化。