北京进行本科二本合并的大学包括：
1. 北京联合大学：北京联合大学是由12所北京市重点高校的分校合并而来，是北京市政府直属的综合性高校，大部分省份是本科二批招生。
2. 北方工业大学：北方工业大学是一所以工为主，文理兼融的多科性高等学府，也是北京市属重点高校，入选了新工科研究与实践项目和国家级大学生创新创业训练计划。
3. 北京建筑大学：北京建筑大学是北京市和住房和城乡建设部共建高校，以工科为主，入选了国家建设行业技能型紧缺人才培养培训工程等多项计划。
4. 北京工商大学：北京工商大学是由北京轻工业学院、北京商学院、机械工业管理干部学院等3所部属院校合并组建而成。
5. 北京印刷学院：北京印刷学院是北京市政府和国家新闻出版总署共建高校，被誉为国家出版印刷高级人才培养基地。
6. 北京石油化工学院：北京石油化工学院是由北京石油化工学院和北京化工学院第二分院合并组建而成。
7. 首都经济贸易大学：首都经济贸易大学是由原北京经济学院和原北京财贸学院合并而成。
8. 北京工业大学：北京工业大学是在高校合并潮中，通过合并原北京联合大学经济管理学院、北京计算机学院等院校而成立。
这些大学通过合并，不仅扩大了招生规模，提升了教育质量，还在各自的专业领域内取得了显著的发展。建议考生在选择学校时，可以综合考虑学校的学科优势、师资力量、校园环境等因素。