苏州大学和福州大学都是国家211工程建设重点高校，也同为省属高校。在综合实力和大学排名方面， 苏州大学略好于福州大学。苏州大学的材料科学与工程学科入选了国家双一流学科，法学、医学、理学、文学和工学实力也很强。而福州大学的优势学科相对偏理工科方向，办学质量和社会声誉均不及苏大。
从地理位置来看，苏州大学位于苏州市中心，周边有银行、小区、医疗场所、超市等，生活便利。而福州大学的地理位置相对较差，周边只有超市和餐饮店。
在专业设置方面，苏州大学总共有120个本科专业，涵盖经、法、教、文、史、理、工、农、医、管、艺等十一大学科门类，而福州大学总共有88个本科专业，涵盖经、法、教、文、史、理、工、农等学科类型。因此，苏州大学的专业更多，选择范围更广。
根据最新的学科评估结果，苏州大学的软件工程和设计学入选A-，化学学科也获得了A-的评价，整体实力较强。福州大学的化学学科同样入选A-，在工科领域如电子信息和化学工程方面表现出色。
综合以上信息，苏州大学在综合实力、专业设置和学科建设方面略占优势，但福州大学在理工科领域也有很强的实力。建议您根据自己的专业兴趣、未来发展方向以及生活环境等因素来选择适合自己的学校。