南京的本科大学排名如下：
南京大学
简称：南大
特点：教育部直属，国家“双一流”建设高校，国家级双创示范基地，九校联盟成员等。
QS全球大学排名：第208位。
东南大学
简称：东大
特点：教育部直属，国家“双一流”和“211工程”重点建设高校，全国深化创新创业教育改革示范高校等。
QS全球大学排名：第251位。
南京航空航天大学
简称：南航
特点：教育部直属，以航空航天科技领域为主，世界航空航天领域的重要研究机构之一。
QS全球大学排名：第462位。
南京理工大学
简称：南理工
特点：教育部直属，江苏省重点高校，拥有良好的国际化水平。
QS全球大学排名：第751-800位。
南京师范大学
简称：南师大
特点：教育部直属，以师范教育和基础学科为主。
QS全球大学排名：第801-1000位。
南京农业大学
简称：南农大
特点：教育部直属，农业部共建的国家“211工程”重点建设高校。
QS全球大学排名：第801-1000位。
以上排名根据QS全球大学排名以及相关信息整理得出，具体排名可能会根据不同的评价体系和时间有所变化。请参考教育部门公布的最新权威信息以获得最准确的排名情况