南京医科大学在大多数情况下被认为是 一本大学。以下是支持这一结论的依据：
录取分数线：
南京医科大学在江苏省物理类本科批次的最低录取分数线为569分，历史类为563分，这表明其在江苏省内是按照一本大学进行招生的。
招生批次：
南京医科大学在全国大部分地区为本科第一批次招生，且学校是“双一流”建设高校，这种情况下，通常认为该学校是一本院校。
教育资源：
南京医科大学是教育部卓越医生教育培养计划试点高校、国家特色重点学科项目建设高校、江苏省高层次人才培养计划——333工程培训基地，这些荣誉和资格进一步证明其作为一本大学的地位。
政策划分：
虽然教育部门并没有明确划分一本和二本大学，但根据南京医科大学在普通类最前的招生批次，以及其在各省的招生情况，可以判断它是一本院校。
综上所述，南京医科大学在多个方面均表现出一本大学的特征，因此可以肯定地认为它是一本大学。