清华大学和国立清华大学的主要区别包括：
学校英文名称缩写不同
国立清华大学：NTHU
清华大学：THU
学校位置不同
国立清华大学：位于中国台湾省新竹市
清华大学：位于中国北京市
主管部门不同
国立清华大学：主管部门为中国台湾地区教育主管部门
清华大学：主管部门为中华人民共和国教育部
学院设置不同
国立清华大学：包括理学院、工学院、生命科学院、电机资讯学院、人文社会学院等
清华大学：包括建筑学院、环境学院、人文学院、美术学院、药学院等
排名和学科实力
清华大学：世界排名16，有23个学科进入全球前50名
国立清华大学：世界排名163，只有一门学科进入全球前50名
历史背景
两者都创建于1911年，最初为清华学堂，1928年国立清华大学成立
清华大学在1946年迁回北京清华园复校，成为中华人民共和国教育部直属的重点大学
国立清华大学在1955年于中国台湾省新竹市复校
以上信息综合了不同时间点的数据，以提供最准确的对比。