水生生物学专业的大学排名如下：
1. 北京大学 （A+）
2. 清华大学 （A+）
3. 上海交通大学 （A+）
4. 中国农业大学 （A）
5. 南京大学 （A）
6. 中国科学技术大学 （A）
7. 武汉大学 （A）
8. 华中农业大学 （A-）
9. 南开大学 （A-）
10. 东北师范大学 （A-）
11. 复旦大学 （A-）
12. 浙江大学 （A-）
以上排名根据最近更新的信息整理而来，具体排名可能会根据不同的评价标准和时间有所变化。水生生物学是生物学一级学科下属的二级学科，因此，排名通常会在生物学一级学科的排名中体现。