关于“大学三本变二本不公平”的观点，有以下几方面的分析：
学生层次差异：
三本院校和二本院校在录取分数线、学生层次上存在较大差异。三本院校多为民营或独立学院，其学生学习能力相对较弱。如果三本院校能直接转为二本院校，将对二本院校的学生造成不公平，因为两者在学术能力和学习基础上有明显差距。
教育资源分配：
三本院校多为民营或独立学院，其教育资源相对有限，而二本院校通常拥有更多的教育资源和师资力量。合并后，原本属于三本院校的学生将有机会进入二本院校，但这并不意味着他们的学习能力和学术水平已经达到了二本院校的标准，这对二本院校的教育质量可能产生负面影响。
高考制度影响：
合并本科批次录取，虽然让部分原本只能上三本的学生有机会读公办的二本院校，但这种制度的改革对二本学生的影响并不大，因为高校的招生数量基本不变。同时，高考分数本来不高，按原来二本、三本分别划线，只能上三本的考生，这下就有机会读公办的二本院校了，这种制度的改革，收益最大的应该是达到三本录取分数线的这群学生了。
证书认可度：
国家的学位证书和毕业证书不会因学校批次的合并而改变，只会写校名，其他都一样。因此，从证书认可度的角度来看，三本变二本并不影响学生的学历和证书的含金量。
综上所述，从学生层次、教育资源分配、高考制度影响以及证书认可度等方面来看，大学三本变二本存在一定的不公平性。这种改革虽然为部分三本学生提供了更多机会，但也可能对二本院校的教育质量和学生群体产生不利影响。因此，在推行此类改革时，应充分考虑各方面的利弊，确保教育公平和持续发展。