东京大学和清华大学都是世界知名的顶尖大学，具有极高的学术声誉和影响力。它们在不同方面各有优势，具体哪个更好需要根据个人的需求和标准来评判。
世界排名
东京大学在世界大学排名中通常位列第20名左右，而清华大学在世界大学排名中位列第50名左右。从排名上来看，东京大学的整体实力略胜一筹。
学科优势
清华大学：在工学、管理学方面表现出色，尤其在理工科领域享有很高的声誉。清华大学的规模较大，本科专业更多，在校学生人数也更多。
东京大学：在理学、医学、人文社会科学方面具有优势，培养了众多诺贝尔奖和沃尔夫奖得主。此外，东京大学的物理学专业世界排名第一，化学和生物学科也位于世界前五。
学术声誉
两所大学在国际上都有极高的声誉，但清华大学在中国国内的认可度和影响力可能更大一些。
学生体验
如果你打算在日本长期发展或学习日语、日本文化，东京大学可能更适合你。而如果你打算回国发展或对理工科有浓厚兴趣，清华大学可能更适合你。
其他因素
清华大学的师资力量、教学质量和科研水平都很高，拥有丰富多彩的课外活动和机会，如学生社团和国际交换项目等。
东京大学是日本最古老的大学，有着悠久的历史和传统，学术氛围和文化环境独特。
建议
如果你更看重学术声誉和全球影响力，且打算在日本发展或学习日语、日本文化，东京大学是更好的选择。
如果你更看重理工科领域的实力和就业前景，且打算回国发展，清华大学可能更适合你。
最终选择哪所大学，还需根据个人的兴趣、职业规划以及家庭背景等因素综合考虑。