在东京，学费相对较低的大学包括：
东京大学：
作为东京六大学之一，东京大学的所有学部第一年度学费为81万8000日元（约人民币4万8989元），是六所高校中最便宜的。
筑波大学：
位于日本茨城县，学费相对较低，每年约为82万日元左右。
东京都市大学：
位于日本东京，学费也相对较低，每年约为80万日元左右。
北见工业大学：
位于北海道北见市，作为国立大学，其学费非常低廉，每年约为2.6万人民币左右（不包括奖学金等）。
这些大学在东京地区提供相对经济的学费选择，对于预算有限的学生来说，可以考虑这些选项。建议进一步了解每所大学的详细专业和费用情况，以便做出最适合自己的选择。