被称为“二本小清华”的学校有以下几所：
华北理工大学：
位于河北省唐山市，是一所以工科和医学为主的综合性大学。华北理工大学在工程、理学、管理学等学科方面较为突出，学校底蕴深厚，就业率也很高，为96%。
上海海关学院：
是我国唯一一所设立海关学科的大学，也是我国录取分数线最高的二本院校。虽然大部分地区按照一本批次招生，但在山西和内蒙古等地依然是二本招生。海关专业的背景使得毕业生在考取公务员方面具有很大优势。
鲁东大学：
位于山东烟台市，以优良的学风和高考研录取比例而闻名。该校的词典文学专业在全国具有知名度，学校名气较高。
成都医学院：
在广西、宁夏、江西、陕西、安徽、贵州等省份进行二本批次招生。作为一所曾经的军医院校，成都医学院在药学、护理学和检验医学等王牌专业上具有明显优势，就业率很高，基本上一直保持在95%以上。
徐州医科大学、 华南农业大学、 山东师范大学等也是被称为“二本小清华”的学校。
这些学校虽然在二本批次招生，但在某些专业领域具有明显优势，就业率和认可度也较高，因此被称为“二本小清华”。建议学生在选择这些学校时，可以结合自己的兴趣和职业规划，选择最适合自己的学校和专业。