上海最高端的大学排名如下：
复旦大学：
复旦大学是中国顶尖的综合性研究型大学之一，拥有丰富的学科门类和强大的综合实力，在多个学科领域具有显著优势，如医学、管理学、新闻传播等。
上海交通大学：
上海交通大学是中国历史最悠久、享誉海内外的著名高等学府之一，以工科见长，是教育部直属并与上海市共建的全国重点大学。
同济大学：
同济大学是一所特色鲜明、在海内外有较大影响力的综合性、研究型、国际化大学，以土木工程专业著称。
这些排名基于不同的评价体系和时间，但复旦大学和上海交通大学通常被认为是中国最顶尖的高等教育机构之一，而同济大学在工程学科方面享有盛誉。