南京的二本大学中，以下几个专业被认为是王牌专业：
南京邮电大学
网络工程：该校的王牌专业之一，就业前景非常好。
电子信息工程：主要学习电子电路、通信原理、信号处理等课程，培养学生具备电子信息系统设计、开发和应用的能力。
通信工程：作为学校的特色专业，与电子信息工程相辅相成，就业前景广阔。
南京工业大学
化工：该校的化工专业非常强，科研成果丰硕，实验室设备齐全。
材料科学与工程：属于材料类专业，是学校的王牌专业之一。
南京工程学院
土木工程：土木工程专业历史悠久，涵盖建筑、交通、水利等多个领域，毕业生就业前景广阔。
电气工程及其自动化：该专业是学校的王牌专业，毕业生就业方向主要是我国电力能源系统单位。
机械设计制造及其自动化：融合机械、电子、计算机等领域，培养具有创新精神的工程技术人才。
南京晓庄学院
小学教育：作为地方特色专业，王牌专业都是师范类专业。
南京审计大学
审计学：该校的优势专业，主要就业方向为会计师事务所和大型企业。
财政学、 金融学、 会计学：这些专业也是学校的王牌专业，就业前景广阔。
南京中医药大学
中医学：作为中医药类院校的特色专业，拥有深厚的学术底蕴。
中药学：中医药类专业的另一个王牌，注重理论与实践的结合。
南京大学
天文学：该校的天文学专业享誉国内外，注重理论与实践的结合，毕业生享有极高的就业竞争力。
软件工程：国家级特色专业，培养学生具备扎实的软件开发和应用能力。
东南大学
建筑学：该校的建筑学专业历史悠久，培养了一代又一代的建筑大师，注重理论与实践的结合。
航空宇航科学与技术：南京航空航天大学的王牌学科，汇聚了国内顶尖的专家学者和先进的科研设备。
这些专业在各自的领域内具有很高的声誉和就业前景，建议学生在选择专业时可以根据自己的兴趣和职业规划进行综合考虑。