黄埔区拥有多所二本大学，以下是黄埔区的二本大学：
广州中医药大学（大学城校区）
广东外语外贸大学（南校区）
广州航海学院（黄埔校区）
广东药学院
广东医科大学
南方医科大学
广州大学
广州商学院
广州康大职业技术学院
广东省城市建设技师学院
广州工程技术职业学院
广州南华工商职业技术学院
黄埔卫生职业技术学院
建议：
广州中医药大学、 广东外语外贸大学、 广州航海学院、 广东药学院、 广东医科大学、 南方医科大学和 广州大学都是广州市内较为知名的本科院校，实力较强，可以考虑报考。
广州商学院、 广州康大职业技术学院、 广东省城市建设技师学院、 广州工程技术职业学院、 广州南华工商职业技术学院和 黄埔卫生职业技术学院等高职院校也提供本科教育，适合对职业技能教育有较高要求的考生。
此外，新成立的 广州交通大学也是一所值得关注的本科院校，正在建设中，未来有望成为黄埔区的一个重要高等教育机构。