东南大学的排名争议主要围绕以下几个方面：
合并影响
观点一：2000年东南大学四校合并，其中包含了一些中专层次的学校，导致整体水平下降，这是排名下降的主要原因。
观点二：在2000年之前，东南大学也排不进前十，与多所顶尖大学竞争第十名，因此排名下降并非绝对。
学校定位与特色
观点一：东南大学在专业就业上表现优秀，计算机和工程学就业率超过95%，且薪资待遇普遍较高。
观点二：东南大学的强吞弱并校措施虽然带来了一些负面影响，但总体利大于弊。
宣传与认知
观点一：东南大学改名后，部分年轻人对学校历史不了解，导致认知度不高。
观点二：东南大学在国内的知名度相对较低，部分外省学生容易误认为它是福建省的重点大学。
评价标准与科学性问题
观点一：以学校整体排名并不科学，因为各学校的特色和侧重点不同，简单的综合排名难以做到完全科学。
观点二：东南大学的实力被低估，其实际学术水平和科研实力并不逊色于一些排名靠前的大学。
地域优势与考生偏好
观点一：东南大学在江苏省内的优势明显，很多江苏考生优先选择东南大学，导致其录取分数较高。
观点二：信息开放后，东南大学在本省的录取分数线并未出现大幅下降，说明其仍具有较高价值。
综合以上几点，东南大学的排名争议主要集中在合并带来的影响、学校定位与特色、宣传与认知、评价标准的科学性问题以及地域优势与考生偏好等方面。虽然存在一些争议，但东南大学在专业就业、科研实力以及地域优势等方面仍具有明显优势，其实际学术水平并不逊色于一些排名靠前的大学。