南京最美的大学排名如下：
南京大学
历史悠久，声誉卓著，春天樱花盛开，秋天银杏金黄，四季景色宜人。
南京师范大学（随园校区）
环境优美，文化底蕴深厚，是南京著名的文化校园之一。
南京航空航天大学
理工科院校，拥有现代化的校园设施和优美的校园环境。
南京理工大学
以其二月兰美景著称，是南京著名的自然景观之一。
南京林业大学
校园内绿化良好，有“森林大学”的美誉。
东南大学（四牌楼校区）
古色古香的校园，是南京著名的历史校园之一。
河海大学
拥有美丽的校园景观和丰富的学术氛围。
南京中医药大学（仙林校区）
中医药院校，校园环境宁静雅致。
南京农业大学
以农业和生命科学为主，校园环境优美，自然气息浓厚。
南京森林警察学院
专注于培养森林警察和消防人才，校园环境整洁有序。
以上排名根据不同的评价标准和时间点可能有所变化，但以上信息可以作为参考。