二本医科大学通常指的是在本科第二批录取的医药类普通本科院校。具体是否为二本院校，取决于该大学在你所在省份的招生批次。如果一个医科大学在某个省份的招生批次是本科第二批，那么它通常会被认为是二本院校。
例如，山东第二医科大学在普通类最前的招生批次是本科第二批，因此，在山东，它通常被认为是二本院校。而哈尔滨医科大学在全国主要是本科一批招生，所以通常被认为是一本大学。
请注意，教育部门并没有正式划分大学是一本还是二本，这种分类主要是基于民间的一种说法和各个大学在不同省份的招生批次。毕业证上显示的均为本科，并不体现是一本还是二本