大学本三和本二的主要区别体现在以下几个方面：
办学层次
本二：普通公办本科院校，通常是省属或市属高校，侧重于理论的应用和实践。
本三：民办本科院校，包括独立学院和民办高校，侧重于应用技能和专业教育。
性质
本二：大多数是公办高校，享有较高的社会认可度。
本三：主要是民办高校或独立学院，社会认可度相对较低。
学费
本二：学费相对较低，一般在几千元/年。
本三：学费较高，一般在一万元/年以上，甚至更多。
社会舆论和认可度
本二：由于是公办高校，社会认可度较高，就业时相对容易获得较好的岗位。
本三：由于是民办或独立学院，社会认可度较低，就业时可能会受到一定程度的歧视。
毕业证书
本二：毕业证书上通常会注明“××大学”，代表其公办性质。
本三：毕业证书上通常会注明“××大学××学院”，虽然都是本科，但毕业证书的含金量和社会认可度有所不同。
教育资源
本二：通常拥有较为丰富的教育资源和师资力量，教学质量和科研水平较高。
本三：由于多为民办或独立学院，教育资源相对较少，师资力量和教学水平可能不如本二高校。
总的来说，虽然本三和本二在本质上都属于本科教育，但在办学层次、性质、学费、社会认可度以及教育资源等方面存在明显的差异。考生在选择高校时，可以根据自身情况和职业规划，综合考虑这些因素。