截至2024年，无人驾驶航空器系统工程专业全国排名靠前的大学有：
北京航空航天大学，专业综合等级为A+，排名第一。
电子科技大学，专业综合等级为B+，排名第三。
中国民航大学，专业综合等级为B+，在民航领域具有较高知名度和影响力。
南京航空航天大学，专业综合等级为A+，位居第二位。
西北工业大学和 哈尔滨工业大学，这两所学校在无人机专业也处于国内领先水平。
沈阳航空航天大学和 南昌航空大学等也是该专业的重要院校。
建议：
北京航空航天大学在无人机领域具有极高的声誉和实力，是首选院校。
电子科技大学和 中国民航大学分别在电子信息技术和民航应用方面具有独特优势，也是值得考虑的选项。
南京航空航天大学和 西北工业大学等也是该专业的重要院校，可以根据具体兴趣和职业规划进行选择。